Merimieseläkekassan hallitus vastaa sisäisen tarkastuksen järjestämisestä. Hallitus hyväksyy vuosittain sisäisen tarkastuksen toimintaperiaatteet ja vuosittaisen tarkastussuunnitelman toimintasuunnitelman yhteydessä seuraavalle kalenterivuodelle joulukuussa.
Hallitus ostaa sisäisen tarkastuksen palveluja ulkopuoliselta palveluntuottajalta.
Sisäisen tarkastuksen tuloksista ja toimenpidesuosituksista raportoidaan toimitusjohtajalle ja hallitukselle. Toimitusjohtajan ja hallituksen on ryhdyttävä välittömästi toimiin mahdollisten havaittujen epäkohtien poistamiseksi.